Allora io ho avuto questo problema anche nella 1.6_6, ho fatto ricerche e sono riuscito a risolvere, ti dico tutto quello che può causarlo:
1. Se i mostri hanno accesso a 2 blocchi di distanza dal letto possono spawnarti mentre dormi, quindi staccalo dai muri o falli di spessore doppio, controlla di non avere una grotta subito sotto anche se è improbabile.
2. Questo è più problematico, sta attento alla porta, se la posizioni dall'interno i mostri possono spawnare, mettila dall'esterno.
3.Questo era il mio problema, le doppie porte, se metti due porte attaccate una verrà automaticamente girata, quindi i mob possono spawnare nel letto, quindi se hai doppie porte che danno all'esterno è meglio toglierle.
Ho letto anche di un bug che causa lo spawn di mostri nel letto se dormi con la fornace accesa ma non mi è mai successo. Prova come ti ho detto e facci sapere :).